
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物技术 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
科学研究的结果
研发的人员探究性因为保鲜时延迟羊肉的硬性、持水、汤色、自由铁成分的、ROS、脂质过氧化反应物、MDA、GSH和GPX4平行来开展相关肌肉组织机构上皮组织细胞的铁消亡状态下。效果信息显示,保鲜时延迟后,羊肉的硬性在第5天和第6天为强势减少;持水技能缩减;颜色搭配变深,逐渐耗尽有光泽,鲜粉大红色转化成暗粉大红色。于此,自由铁、活力氧和MDA的成分的为强势增强,上皮组织细胞凋亡率为强势偏高。 理论研究职工抽取有差异形 食品冷藏时段的身体肩部肌肉合格品的核氨基酸,第二进行SDS-PAGE深入研究分析,核氨基酸条带在有差异形 期间地域分布不匀且相拟(图1a)。会根据核氨基酸在有差异形 合格品中的表现情况下,深入研究分析察觉到同组合格品的中六位数介于于同情况(图1b),说明书身体肩部肌肉合格品核氨基酸都具有比较好的组内相拟性和组间差异形性。 核核苷酸组学共司法鉴别会出1996种核核苷酸。以B0为對照组,选择B1、B2、B4和B6中的核血清来进行性别区别抒发出了解,共司法鉴别会到376个DEPs。将火山图大数据可视化,并要根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05俩个标准的了解DEP。但是如图甲如图1c-f如图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别司法鉴别会出22、33、73和140个DEPs,这其中分头别调涨6、11、32和8九个,调低16、22、41和54个。聚类分析的方法监测了区别冰箱第一阶段胸肌团体中核核苷酸的抒发出,但是显视胸肌核血清抒发出性别区别逐渐储放时刻的加大而加大(图1g)。
图1| 有所不同冷藏库耗时的健身肌肉试品血清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 对比冷库用时的肌肉组织样本对比蛋白质研究分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁消亡核蛋白肽的PRM定量剖析剖析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 研究背景KEGG聚集差异性展示蛋白质的铁自杀体制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生态学提供了TMT酶联免疫法球脂肪酸组学技术应用应用服务的管理,拜谱海洋生物已技术应用创新达到并开发了不断完善稳重的转录组学、球蛋白质组学、产生组学或两组学联合技术应用厂品技术应用应用服务的管理机制,欢迎致电咨询!
参考选取学术论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.