
2024年9月由南京市绿植基地二本大学张万刚客座教授项目团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱微生物为该研究提供了亚硝基化装饰组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
汉语文章标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
杂志:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202四年会影响要素:5.7
文章发表用时:2024年9月
的客户企事业单位:南京农业大学
探析文件:蛋白
拜谱提供数据工艺:亚硝基化修饰组学
方法路经:
一、论述没想到
01.Caspase-3活性氧
目前为止尚不看不清楚NO对caspase-3的减缓功用有无归因于NO介导的S-亚硝基化,不同的盐浓度系数的GSNO用于外源性NO供应商,以分析caspase-3的身体S-亚硝基化。结论证明,与不会有GSNO的组差距,100、200和400μM GSNO组的caspase-3可溶性显著性减小(图1),与原先新闻报导不一。GSNO整理减小caspase-3可溶性的意向根本原因仍进一步说明。
图1 多种浓度值的GSNO治疗对caspase-3活性酶类的引响
02.Caspase-3的S-亚硝基化层次
的理论研究分析Caspase-3的亚硝基化的的程度,以阐释GSNO对Caspase-3的想法性。经GSNO除理后,在线检验到caspase-3血清S-亚硝基化抗拉强度扩大(图2)。这一些后果反映,外源性GSNO培训可完美诱发caspase-3的离体S-亚硝基化。真让人惊呆的是,在不能GSNO存在着的照表组中在线检验到一两个很弱的S-亚硝基化带,这反映caspase-3会出现内源性的S-亚硝基化。除此以外,本的理论研究分析中caspase-3的S-亚硝基化的的程度较高,而caspase-3的活性酶类降低,这与之后的的理论研究分析不一样。同时,caspase-3的特情人S-亚硝基化装饰位点尚不看不清楚,还可以更加骤的思考。
图2 GSNO处里对caspase-3S-亚硝基化技术水平的作用
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化遮盖组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。黄色图标的字段表现S-亚硝基化肽,红图标的C表现S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3挥发结蛋白质
结蛋清酶质看作那种重点的组织血细胞骨架蛋清酶质,在保持肌组织血细胞的结构特征的的结构特征全面性和收縮性个方面起着重点点帮助,钻研S-亚硝基化caspase-3对结蛋清酶质化学降解塑料的铭物质性存在重点意议。与Std(未用胱天蛋清酶质酶-3和GSNO孵育的刚开始肌玻璃纤维素蛋清酶质)组不同之处,0 μM GSNO组(肌原玻璃纤维素和caspase-3的孵育,无GSNO)的全面结蛋清酶质含水量的相关系数调低,显示caspase-3对结蛋清酶质存在不确定性的蛋清酶质溶解业务能力。在GSNO孵育后,全面结蛋清酶质的含水量的清晰增强(P < 0.05)。最后,当GSNO质量浓度偏高时,全面结蛋清酶质的含水量的定期上浮(P < 0.05)(图5)。某种发掘表述,SNO修饰语的caspase-3以的水平依耐的习惯抑制作用结蛋清酶质的化学降解塑料。
图5.S-亚硝基化caspase-3可降解结蛋清
05.S-亚硝基化Caspase- 3降解塑料肌钙血清-T
肌钙淀粉酶-T (TnT)是原肌球淀粉酶的调高全权负责手臂肌肉伸缩的细条的一定肌原食物弹性纤维素淀粉酶。TnT的吸附表现形式是判断到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化生活条件下,caspase-3对TnT的吸附状况如下图6如图所示,与Std组(只含caspase-3和GSNO的肌原食物弹性纤维素)相对比,caspase-3组中30 kDa TnT片断相关性添加,得出结论caspase-3参予了TnT的吸附,还有,caspase-3与GSNO的孵育以至于30 kDa TnT骤降。在100和200 μM GSNO组期间不会有判断到清晰的差别(P > 0.05),而当GSNO的浓硫酸浓度达到了400 μM 时,该片断相关性缩短(P < 0.05)。这种发展得出结论了SNO遮盖的caspase-3对TnT吸附的克制作方法用。结淀粉酶和TnT是caspase-3的明感底物,而GSNO净化处理调低caspase-3的吸附性也许 以至于肌原食物弹性纤维素淀粉酶吸附方面调低。综合上面的提出的,NO引发的S-亚硝基化还可以在遮盖半胱氨酸残基来的调高caspase-3的吸附性,以致进1步关系其对结淀粉酶和TnT的淀粉酶淀粉水解功能,所以关系牛肉片产品质量。
图6. S-亚硝基化caspase- 3吸附肌钙蛋白质-T
二、个人心得体会
本研究研究综述为了更好地研究综述S-亚硝基化对caspase-3体现的影向还有其随即对鸡肉肌原纤维材料棉离体生物降解的影向。球球蛋白质S-亚硝基化是可以体现caspase-3的半胱氨酸残基,最终得以产生caspase-3亲水性降,进三步治理和改善了其对鸡肉肌原纤维材料棉球球蛋白质的球球蛋白质溶解效率。三、拜谱个人总结
探析用于了酶活校正,亚硝基化体现组学了解,WB等检则有效途径,遇到蛋清S-亚硝基化也可以体现caspase-3的半胱氨酸残基,这影响了caspase-3化学活化的减少,并举一次抑制作用了其对鸡肉肌原食物纤维蛋清的蛋清核膳食纤维水解效果。本探析为解释一下蛋清质亚硝基化对色泽的调节规则出示打了个个新的角度 。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的核胆固醇组学、绘制核胆固醇组学、分解代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系类新产品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺硝化作用、total腐蚀备份、徘徊巯基,欢迎大家咨询!
参考使用资料:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663