
近日,常州医科师范大学首个附设医生王学浩中科院院士组织在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶点势能分泌检测分析服务。
国外英文子标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
英文版题头:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
消费者单位名称:南京医科大学
研究探讨涂料:细胞
拜谱带来服务项目:转录组测序+球蛋白互作组+靶向疗法体力分解组
技术工艺自驾线路:
深入分析成果
01、YBX1被鉴定费为HCC中糖酵解的主要DNA
本的研究统计动态数据采集HCC肿癌样品(n=7)的单上皮组织核RNA测序统计动态数据集进行了解,显示糖酵解吸附性基本集中化在肿癌上皮组织核中,hdWGCNA了解辨识出9个基因遗传信息模块(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的生活了解设定YBX1为单独的生活的风险重要因素(图1H)。进一歩根据IHC、WB检测和肿癌聚集与毗邻非肿癌聚集的空间区域转录组学统计动态数据集得知YBX1是肝上皮组织核癌制疗的自身靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确实为缓解HCC细胞核糖酵解的关键所在缘由
02、YBX1驱动HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物能力新陈代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1使得HCC中的有氧糖酵解和繁衍
03、OGT与YBX1运用并利于YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,球蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1配合并可以淡化YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增进其磷过酸,而可以淡化其核转位
进一点论文检测YBX1的O-GlcNAc糖基化要不要危害其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC生殖细胞膜中或用OGT减弱剂OSMI-1加工,YBX1球蛋清平均水准相关系数变低,YBX1磷硝化作用相关系数才能减少(图4A-C)。IP工作得知,在一模一样的Flag-YBX1底物平均水准下,YBX1-WT的磷硝化作用平均水准相关系数低过YBX1-T57A,得知磷硝化作用的添加不禁仅是为了更为重要的YBX1球蛋清表述(图4D)。提取了核和质多组分得知TMG加工的HCC生殖细胞膜中YBX1核表述的提升(图4E-F),进一点得知YBX1磷硝化作用的重要性调理细胞因子是AKT(图4G-I)。这个得知着重于O-GlcNAc糖基化借助增进其磷硝化作用来改善YBX1球蛋清适用性处理性并增进核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 表达重要于其进每一步突发磷过酸表达并会有利于其核转位
05、YBX1提高PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1驱动PKM2转录
06、YBX1 就能够升高组蛋清乳碱化表达总体水平
研发找到YBX1敲低重要变低核苷酸质乳硝化成用,更是是H3K18乳硝化成用(图6A-C)。糖酵解缓和剂2-DG的科学实验断定了糖酵解与组核苷酸乳硝化成用的进行相关,缓和糖酵解可重要变低H3K18la标准(图6D)。PKM2过展现不可逆转转YBX1敲低而致的H3K18la下跌,之外源乳酸治理往往优化H3K18la,还伴着YBX1展现上浮,提示信息存有正方向汇报(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR断定,H3K18la使用生物富集于YBX1启动时子进行有利于促进其转录,该工作受O-GlcNAc糖基化调节作用(图6H-J),并找到P300 上浮是YBX1明显增强H3K18乳酰化成用的工作机制(图6K-L)。
图6.YBX1改善H3K18乳硝化作用绘制的水平
短文总结ppt
在此项论述中新闻报导了YBX1在HCC中高表达方式方式,还有就是与糖酵解开切相应联。YBX1在T57处被O-GlcNAc掩盖,然后维持蛋清质并新增其表达方式方式。这掩盖还有利于YBX1在T57处的磷酸性反应,有利于其核易位。因为,这整个过程减弱了糖酵解相应联什么是什么是基因的转录并伤害性乳酸的导致。除外,YBX1激活卡P300的转录,随之驱程组蛋清的乳酸性反应,非常是H3K18la,H3K18乳酸性反应正向着控制YBX1什么是什么是基因转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隐性基因双面馈环机能图
拜谱个人总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物制品为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向治疗正能量新陈代谢组技术服务,拜谱生物体建立了完善成熟的转录组学、球蛋白组学、翻译资料后突显组学、产生组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
选取资料
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.