拜谱生物

400-820-8531
News center
拜谱生物
首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 数据网络临床药理学表明草酸钙肾结石脱色应激状态和支原体感染损坏长效机制

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿操作装置里普通的疾病症状的一个。肾组织化中CaOx硫化锌过呈现饱和状态积累会影响肾小管上皮细胞神经损伤和凋亡,才能影响肾结石的达成。短链碳水化合物酸由可以使肠胃内厌氧反应器细菌病毒酵伙食纤维棉造成,这不仅在一部分可以使肠胃第一道防线中产生功能,同时在操作装置平均水平上也产生重要性功能。这之中,丁酸是最丰富性的短链碳水化合物酸,拥有免疫细胞控制和免疫细胞控制功能,本试论试论丁酸对CaOx肾结石的功能举例风险靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山卫生院泌尿美容外科吴忠硕士生导师、周子健教授于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠专家、周子健博士研究生在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱怪物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网咯临床药理学精准服务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

原创文章公司名称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 的客户组织:华山卫生院 调查群体:大鼠、HK-2細胞 排列消息:照表组(Con)、绘图组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱给予技术性:网上药剂学学检查

理念方法图

论述报告单

深入分析方案拜谱生物应先建设方案大鼠型号,完成生理方面生化模式技术指标和安排疾病学印染等深入分析方案的手段知道丁酸还可以提高CaOx型号大鼠肾CaOx晶胞的建立和挫裂伤,改善CaOx型号大鼠的疾病挫裂伤和空气被氧化物品的过快表现。最后,丁酸还可抑止草酸引导的HK-2细胞系系挫裂伤、空气被氧化应激状态和细胞系系凋亡。 为探究性丁酸的结构的和靶人类染色体遗传组遗传wifi网,探析员工从PubChem了解丁酸和丁酸酯的二维和三维立体的结构的(图1A)。借助PharmMapper数据显示资料报告库和Uniprot数据显示资料报告库整理后共建立出113个丁酸靶人类染色体遗传组遗传供进那步解析。将人类染色体遗传组遗传具体信息导出来STRING数据显示资料报告库,开展PPIwifi网解析。Cytoscape拿出了顺序的前20的联络线站靶人类染色体遗传组遗传的具体wifi网图,是指CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这样联络线站人类染色体遗传组遗传与wifi网中的其余人类染色体遗传组遗传均症状出肯定的管于于性,证明这样人类染色体遗传组遗传或许树立着联合现象。GO和KEGG解析论述了丁酸联络线站人类染色体遗传组遗传的管于于方式和菌物学用途(图1C)。联络线站人类染色体遗传组遗传基本与类固醇皮质皮质激素回复、空气阳极氧化应激状态现象回复、亲水性氧癌细胞对类固醇皮质皮质激素影响的现象并且 对偏酸化学有机化合物有机化合物的现象管于。表示表示,这样联络线站人类染色体遗传组遗传基本进行了空气阳极氧化应激状态现象和对亲水性氧的菌物现象工作,是肾结石行成原则中至关注重的方式,这表示丁酸或许在肾结石中树立注重现象。

图1| 丁酸的结构与靶染色体网站进行分析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进每一步探究丁酸对CaOx肾结石当然切靶表观遗传组,实验员工回收利用GEO数据分析资料库对GSE73680中营养相较比较与CaOx肾结石用户的表观遗传组差别来来了实验。相较比较组与CaOx结石用户的取得能力差别展示方式方法表观遗传组(DEGs)淘汰要求为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共淘汰到3783个表观遗传组发生了取得变幻,之中3379个(89.4%)表观遗传组展示方式方法上涨,404个(10.6%)表观遗传组展示方式方法上涨(图2A)。对DEGs来来聚类分析了解法了解,热图展示了前10个被选中DEGs的二维分段聚类分析了解法特性(图2B)。己经,实验员工利用GeneCards数据分析资料库人工客服鉴定会了370个有可能与CaOx肾结石相应的的表观遗传组,排民前20位的預測表观遗传组以及其相应的性评判长为2C下图。为了能够找寻丁酸治疗方法CaOx肾结石的重中之重靶点,实验员工将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相应的表观遗传组外理达到新一个Venn图。最后,CYP2C9被明确为丁酸导致CaOx肾结石的潜在的靶点(图2D)。与此同时,实验员工还来来了丁酸与CYP2C9的团伙连接,CYP2C9的多个酪氨酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸共同帮助,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在利用手机网络临床药理学分析CYP2C9是丁酸关系CaOx肾结石的靶DNA后,钻研相关人员还能够 癌肿瘤细胞测试印证了CYP2C9可减低草酸引导的HK-2癌肿瘤细胞的ROS技术、感染挫裂伤和凋亡。

图2| 而言据库协同分折預测CYP2C9是丁酸意义于CaOx肾结石的靶dna

研究探讨但是

本论述一方面看见丁酸在人体内和人体内均能促使CaOx肾结石模板的防钝化应激性反应和感染软组织拉伤,继而使用系统药剂学学学建立受到丁酸作用CaOx肾结石的自身靶点——CYP2C9,之后使用组织内部实验报告灵魂存在CYP2C9在草酸盐诱发的HK-2组织内部ROS质量、感染软组织拉伤和凋亡。以下看见反映出丁酸将会使用促使CYP2C9来促使CaOx肾结石的防钝化应激性反应,降低感染软组织拉伤。这操作过程中拜谱菌物能提供了系统药剂学学学技艺服務保障,凡此种种拜谱菌物可上升较为成熟健全的人类基因组学、核膳食纤维组学、细胞代谢组学等几组学企业产品及技艺服務保障,喜欢拨打电话在线咨询! 借鉴医学文献:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物