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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核海洋生物工程mRNA中最沉要的转录后遮盖,在真核海洋生物工程的病理学和女性生理方式中起着至关为重要的反应。高血压认识程度心里障碍有的是种不可逆反应的运动神经末梢神经末梢系统的退行性的疾病,现如今发展前景真实切制度化还没全阐述,另外缺少很好的的防治和方法的手段。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱微生物为其提供m6A甲基化剖析能力服务项目,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

论文名号:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

客服机关单位:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

研究分析用料:小鼠脑组织

拜谱供应技術:m6A甲基化(MeRIP-seq)

文献综述图:

图1| 小结图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

研究方案最终结果

1.DCI小鼠海马中m6A人类基因体现的变换

讲解专业人群率先加入了高脂饮食健康和群体行为性障碍(DCI)的小鼠模型工具。为会比较相较比较组(n = 3)和DCI组(n = 3)区间内的m6A什么是表观遗传装饰,讲解专业人群应用MeRIP-seq进行了转录组范围之内内的m6A-seq讲解。在DCI组的10664个数字什么是表观遗传转录物(mRNAs)中国共产党出现相较比较组的237一个不交叠的m6A峰。相对于之端,DCI组表現出23,75-7个非交叠m6A峰。这里面,9345-7个甲基化什么是表观遗传在相较比较组和DCI组区间内交叠(图2)。

图2| 差表组和DCl组m6a淡化基因遗传的维恩图

共检验出1273个区别甲基化的m6A位点(DMMSs),其中的60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化水准分开正相关不低于对应组。分折其地理分散不均情况发生表明m6A峰地理分散不均在整RNA中(图3A),并结合其地理分散不均的转录地区分成之下五组:5'UTR、3'UTR、转录起点位点地区段落、停止支付账户支付密码子段落、起点支付账户支付密码子段落和编号队列(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和停止支付账户支付密码子付近正相关丰度(图3B)。要评定方法某些遗传DNA上m6A呈现的地区,理论研究人工选择了有峰注解的地区,并测试了某些遗传DNA上reads的包含率。在DCI组中,m6A呈现区歪向于3'UTR区(图3C)。几乎所有mRNA内的DMMS都被确定到刺绣体起来评定方法其地理分散不均简况。不相同小鼠刺绣体的m6A呈现谱不相同。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的修改

为考验m6A呈现在DCI小鼠中的怪物学效果,设计人士从几组数中择包含有DMMS的蛋白酶质商品编码遗传遗传染色体遗传实行GO和KEGG定性深入进行具体研究分析(图4A)。在GO定性深入进行具体研究分析中,高甲基化遗传遗传染色体遗传在癌组织的工作、怪物的工作国家宏观调控、促使灵亲水性和杂环氧化物联系中重要丰度。KEGG环路定性深入进行具体研究分析表明,高甲基化遗传遗传染色体遗传与T癌组织蛋白激酶表现环路、小癌组织肺肿瘤和RIG-I样蛋白激酶表现环路相应(图4B)。相对 低甲基化遗传遗传染色体遗传,GO定性深入进行具体研究分析表明在癌组织的工作、代谢率的工作和联系的工作中重要丰度有机会环氧化物、联系杂环氧化物和促使灵亲水性(图4C)。KEGG环路定性深入进行具体研究分析论述了低甲基化遗传遗传染色体遗传与肥厚性心肌病和Hippo表现环路的联系(图4D)。

图4| 一定的差异甲基化m6A位点的信号通路丰度

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq动态数据的连合分享

那么钻研考生将m6A MeRIP-Seq的大数据显视和此前RNA-Seq的大数据显视开展联席讲解,发现了163个mRNA,m6A峰和mRNA标准有明显变化。41种mRNA的m6A和mRNA标准上涨,14种mRNA标准下跌。然而,30个DNAmRNA展现上涨,m6A标准下跌,73个DNAmRNA展现下跌,m6A标准上涨(图5A)。之后,共建了个PPI线上来显视163个DNA项目编码的蛋清两者之间的链接(图5B)。

图甲中6图甲中,GO和KEGG浅析可以分为四组:(1) m6A上浮,mRNA上涨;(2) m6A上浮,mRNA上浮;(3) m6A上涨,mRNA上涨;(4) dnam6A上涨和mRNA上浮。在GO浅析中,m6A上浮和mRNA上涨的dna在癌受损人体上皮细胞分解产生的时候、香熏族无机化合物海洋生物生成的时候和RNA分解产生的时候的管控中差异性含有。KEGG浅析凸显,这个dna在油脂的酸分解产生、小癌受损人体上皮细胞肺肿瘤、丙酸分解产生和二甲苯酸分解产生中含有。而对于m6A上浮和mRNA上浮的dna,GO浅析凸显在亚铁构建、亚胺丙氨酸脱羧酶化学活化、天冬氨酸1-脱羧酶化学活化和癌受损人体上皮细胞进行连接組裝负管控中含有;KEGG浅析凸显在2型糖尿病患者、油脂的癌受损人体上皮细胞细胞数字无线电磁波无线电磁波电磁波信号通路和胰岛素数字无线电磁波无线电磁波电磁波信号通路中含有。在GO浅析中,m6A上涨和mRNA上涨的dna在寡肽构建、谷胱甘肽构建和二硫阳极腐蚀物质阳极腐蚀回归酶化学活化中含有,而在KEGG浅析中,它们之间在青柠檬酸再循坏(TCA再循坏)、丙酸分解产生和多植物物种凋亡中含有。在GO浅析中,m6A上涨和mRNA上浮的dna在胚胎骨肘关节特征遭受、蛋清激酶化学活化刺激启动和NADP分解产生的时候中含有,在KEGG浅析中,m6A上涨和mRNA上浮dna在新霉素、卡那霉素和精神菅养细胞数字无线电磁波无线电磁波电磁波信号通路中含有。

图5| m6A甲基化与mRNA把你想表达出来的联动剖析

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG探讨

拜谱生物技术工作小结

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱动物提供了m6A甲基化能力安全服务,拜谱海洋生物可提供完善成熟的核蛋白组学、代谢率组学、转录组学并且多个学协同设备技術精准服务,欢迎致电咨询!

符合论文资料:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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