
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸表达蛋清组学产品,实现1000+高妙度呈现位点检测,稳定可靠初现原素靶点,全方向生信解析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发觉”到“验证通过”全操作流程贴心服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、研究的流程
02、场地实测动态数据
03、经“点”显现
在测评统计数据中,验出很多文献综述中媒体报道的有趣靶点十分衣康酸装饰位点,如第一家个被遇到的衣康酸共价装饰球血清KEAP1,有着糖酵解信号通路中的3个重要的因素酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,及炎性小体分为球血清NLRP3和内部病变的时候中的重要的因素球血清RIPK3等,其质谱图详细图所显示。
04、企业产品亮点
1.很多质控
商业楼化特男人测试探针孵育、SDS-PAGE监测、WB效验、样本量相关性介绍介绍等几方向位置监测,狠抓工作结杲牢靠性。2.高特性质谱设备工作平台
在Orbitrap Astral全新一带高判断质谱仪支持下,体现衣康酸性反应淡化位点及血清判定新深层次,助推器有效实验新察觉到。3.全流程图一走式业务
立于拜谱菌物改善的科学试验工作平台,可展示“组织细胞的培养→测试探针孵育→WB的探测→举重若轻度衣康过酸遮盖的探测→独有生信介绍→某位点PRM效验”全的流程服务性,省时杠杆原理更好些。05、分折项目(那部分)
06、选用放向
PART 2、文献综述介绍
论文一
英文音标标题格式:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
中文名字宝贝标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
实验资源:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
论文二
英文版问题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
中文翻译名称:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
探析信息内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、例并衍生思维
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13更具很强的底物配合学习能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生物制品衣康过酸突显组试验数据表格中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应表达(如下图所示图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱个人总结
有所作为TCA反复的中的中产生物,衣康酸转换产生、免役性抗体和发炎中的互不的功效,为治療免役性抗体发炎性皮肤传染性疾病提高了使用治療策咯。衣康酸组成部分中的亲电性α,β-不饱合羧酸组成部分能对营养素质上的抗逆性半胱氨酸残基完成烷基化遮盖(迈克尔暴伤响应),这类翻译专业后遮盖被称之为“衣康酸遮盖(itaconation)”,继而导致营养素质性能,调节作用免役性抗体初次应答和产生经过,为三种皮肤传染性疾病用量研发团队提高新思绪。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用呈现血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物生物学任何时候一定量靶点基础代谢组(QMT1000)或激光能量产生靶向疗法产生组货品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
分类专著
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.