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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抗体阳性动物群特情人、寡核苷酸遮盖人工成本昂扬或实操标准流程繁复。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯硕士生导师开发团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低料工费、跨鱼类、全公司兼容的全新解决方案。

刊物百科

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由国内有学科院隔代隐性基因性基因与健康成长怪物学数学实验研所和国内有隔代隐性基因性基因先学会举办单位的国家学术界研发刊物,坚持创新驱动于新闻报导宝宝学科和医疗隔代隐性基因性基因学研发方向的原创基地性数学实验研发优秀成果。JGG 202历经四年度作用指数7.1,Scopus学术界研发刊物点评目标CiteScore 9.9,居首JCR 202历经四年度GENETICS & HEREDITY研发方向Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY研发方向Q1区,居首国内有学科院刊物区域怪物学专业类别1区(Top刊物),隔代隐性基因性基因学和菌物化学与原子怪物学小类双1区。

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之类是HEATag

精巧的“二一体化”规划

HEATag是由凝集素和HUH内切酶结构的深度融合蛋清

「分析器」板块 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化遮盖(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「无线接插件」模块电源 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)数据库索引条型码开始共价联接。

“1+1>2”的视觉效果:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样版标签与可追溯。

Fig1: HEATag丰富标注原因展示图

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实际战斗检则

HEATag不懈有点能打?

可能在不一先决条件下,变现哺乳期绿色生殖体细胞系单生殖体细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。研发团队图片为 HEATag 快速设置了多轮 “负担测验”,从上皮上皮细胞系到上皮上皮细胞结构,从低溫到低溫,从新鲜模板到加固模板,全地方验正它的经济性分析高性和可信性。

首位轮公测面对母乳喂养动植物肿瘤人体内部系:理论研究者进行了根据人、鼠、仓鼠三大种类的四大肿瘤人体内部(HEK293T、K562、MEF、CHO),在常温下使用 HEATag 标示后混合法测序。然后回收分类处理的 11447 个肿瘤人体内部中,85.66% 都能用 HEATag 长条码更准符合到原种类,样品间交错的污染较少,UMAP 聚类浅析法浅析还间接证件,HEATag 长条码与种类特男人基因组组症状角度相一致。 接下来,检查情况进一歩升阶:钻研员去尝试在 4℃下图标清新松茸神经元核、在制冷下图标甲醇紧固神经元核,几乎随时图标神经元核核。最后还吸睛:几乎所有情况下,样品价签与种类内容均具备有挺好的有关性,分割准确性率超 95%。即使是甲醇紧固会影响较轻的转录本交叉式的污染,神经元核核提纯老有少许 RNA 损失,神经元核形式的标注最后还与清新松茸样品做到不对,介绍信 HEATag 能图标与众不同清理情况下的检测样品。

Fig2: HEATag 可在各种不同经济条件下已完成单细胞膜转录组混样浅析

会符号母乳喂养宠物和海洋能无脊柱宠物的原代内部

如果你说血血细胞系测试测试是 “前提题”,那机构模本就是说 “叠加题”, 以下模本经常因血血细胞类型、缜密、区域环境自我调节性特别,加入标上枝术的 “常见问题”,而 HEATag 刚好在以下 “常见问题” 上增添了其优势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组织性,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞一方面能被最准确区别,全部的最主要的组织细胞型的聚类算法的结果都不清可辨。

更令人惊喜的是HEATag对大海生物制品的适用性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长形码与鱼类转录组极具较高不同性,还没有有因高盐的环境会造成的 “标记图片不可用”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可满足哺乳期间软体动物组织安排模本强有力的加密管控 scRNA-seq 介绍

Fig4: HEATag可确保新鲜毛肚浅海无脊椎骨宠物很多 scRNA-seq 具体分析

HEATag与神经细胞的根据不诱发转录组的有明显发生变化

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在完成目标任务标注目标任务的同一,没对事后的转录多组分析发生干扰信号,保障了科学研究数剧的现实性。

Fig5: HEATag不引响样版的 RNA 抒发方式

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末来可期

HEATag 能为单肿瘤细胞探索带来了那些?

HEATag 的市场价值,远不仅于 “满足图标现象”,它的灵巧性和共通性,真正为单组织学习打开微信非常多成功率

从选用游戏场景而言

HEATag 能涵盖从 “容易会比较分折”(如癌安排结构与正常值安排结构、中成药操作与较)到 “大市场整体规模研究方案”(如安排结构肿瘤癌细胞图谱画制、高通骁龙量建立)的全超范围诉求。时间推移 PIP-seq、Stereo-cell 等新可映射技术应用的成长,HEATag 还能进一大步提升自己单肿瘤癌细胞研究方案的通量,四轮驱动研究技术团队开设更高市场整体规模的新项目。

从跨方面空间来

HEATag 不光适合于转录组学,还能与表观基因组组学、淀粉酶质组学、区域空间组学等技术应用性融合,确认自定义检索和寡核苷酸队列,HEATag 可容易融进各种的组学步奏,不引响走势猎取深入。同時,对于HEATag还可未来发展单受损细胞糖组学研究方案技术应用性。

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协作动态数据

拜谱动物与陈凯教学实现分步进行合作相关

不错注意的是,在 HEATag 的技能创造出很大广泛采用发展空间的的背景下,拜谱动物技能已与华南地区海底能的工作与工程建筑长沙的工作室(长沙)陈凯专家确定大概合作的有意向。对方筹划环绕 HEATag 的技能的品牌化落子、深入分析导出等朝向开展进一步协同作战,着力推进上述低料工费、跨动物群的单人体组织细胞核标识的技能很快广泛采用于具体深入分析应用场景,为越来越多的工作室提供了快速、城市发展的单人体组织细胞核深入分析工具软件,肋力深入分析的工笔者在人体组织细胞核动物技能学、海底能动物技能学、问题长效机制等行业领域拥有越来越多强化
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